С хидроколонтерапия се постига много ефективно изчистване на дебелото черво. Продължителността на тази процедура е около 40-50 мин. За промиването се използва голям обем вода. Ако при клизмата водата постъпва в ректума и долната част на колона, при хидротерапията водата постепенно се разпространява по цялата дължина на дебелото черво. Д-р Уокър прави следното сравнение, че

една хидроколонтерапия е равна на 30 клизми.

Апаратурата контролира налягането и температурата на водата. Тя увлича фекалии, слуз, продукти на възпалението, газове, които изтичат през тръба. Отсъства неприятна миризма и дискомфорт от спазми или болки. 

Процесът на хидроколонтерапия е с доказана полезност при следните оплаквания:

Запек
Подуване на червата
Диария
Хроничен колит
Чревни хронични микози
Паразитози
Алергични заболявания
Кожни заболявания
Хронично главоболие
Наднормено тегло
Хипо- и хипертония
Отслабнала имунна защита

Неподходящи за хидроколонтерапия са хора с:

Болест на Крон
Язвен колит
Дивертикулоза на дебелото черво
Остри хемороиди
Тумори на ректума
Анемия
Хернии
Скорошни операции
Фисури на ануса
Бременност
Цироза на черния дроб 

Хидротерапията е процес на естествено прочистване. За възстановяване на благоприятните микроорганизми в червната лигавица трябва да се приемат пробиотици след това.